材料がゲル電気泳動によって分離された後にDNAを視覚化して写真を撮るために使用できるいくつかの異なる染色がある。 多くの選択肢の中で、これらの5つの菌株は、最も広く使用されているエチジウムブロマイドの最も一般的な始まりです。 このプロセスを扱う際には、系統間の違いだけでなく、固有の健康リスクを知ることが重要です。
01エチジウムブロマイド
臭化エチジウムはDNAを視覚化するために使用される最も有名な色素である可能性が高い。 この染料は、ゲル混合物中、 電気泳動用緩衝液中、またはゲルの泳動後に染色するために使用することができる。 色素の分子はDNA鎖に付着し、UV光下で蛍光を発し、バンドがゲル内のどこにあるかを正確に示します。 その利点にもかかわらず、臭化エチジウムは潜在的な発癌物質であるという欠点があるため、細心の注意を払って取り扱わなければならない。 このゲルを使用することによる潜在的な健康リスクのために、代替物が見出されている。 02 SYBRゴールド
SYBR Gold色素は、二本鎖または一本鎖DNAを染色するため、またはRNAを染色するために使用できます。 SYBR Goldは、市場に出てくる臭化エチジウムの最初の選択肢の1つであり、臭化エチジウムより感度が高いと考えられています。 色素が核酸に結合すると、色素は1000倍大きなUV蛍光を示す。 その後、厚くて高いパーセンテージのアガロースゲルに浸透し、ホルムアルデヒドゲルで使用することができます。 結合していない分子の蛍光は非常に低いので、脱染色は必要ではない。 ライセンスホルダーMolecular Probesは、SYBR Goldの発売以来、臭化エチジウムの安全な代替品であるSYBR SafeとSYBR Greenを開発、販売しています。
03 SYBRグリーン
SYBR Green IおよびII染色剤（再び、Molecular Probesによって市販されている）は、異なる目的に最適化されている。 それらはDNAに結合するので、潜在的な変異誘発物質と考えられており、そのために注意して取り扱う必要があります。 SYBR Green Iは、二本鎖DNAとの使用に対してより感受性が高い一方、SYBR Green IIは、一本鎖DNAまたはRNAとの使用に最適です。 よく知られている臭化エチジウム染色と同様に、これらの非常に敏感な染色はUV光下で蛍光を発する。 04 SYBRセーフ
SYBR Safeは、Ethidium Bromideや他のSYBR染色剤よりも安全な代替品になるように設計されています。 毒性試験では急性毒性がないことが示されているため、有害廃棄物とはみなされず、一般的に下水道システム（すなわち排水管）を通って処分することができます。 試験は、シリアンハムスター胚（SHE）細胞、ヒトリンパ球、マウスリンパ腫細胞、およびAMES試験において、ほとんどまたは全く遺伝毒性がないことを示している。 この染色剤は青色光トランスイルミネーターと一緒に使用することができ、視覚化されるDNAへのダメージが少なくなり、後でクローニングする際の効率が向上します。 05エヴァグリーン
Eva Greenは、他の色素よりも少ない程度でPCRを阻害することが見出されている緑色蛍光色素である。 これは定量的リアルタイムPCRのようなアプリケーションに非常に有用です。 DNAの回収に低融点ゲルを使用している場合にも、これは良い選択です。 これは、高温で非常に安定であり、それ自体は非常に低い蛍光を有するが、DNAに結合すると非常に蛍光性である。 Eva Greenはまた、細胞毒性または変異原性が非常に低いかまたは全くないことが実証されている。